关键词:GROMACS;冰;拉伸; 分子动力学模拟
冰(尤其是六方冰 Ih)的微观力学性能直接影响到极地工程、寒区交通、冷热循环材料以及航空航天器在超低温环境中的安全与可靠性。传统宏观实验很难捕获纳米尺度下冰的裂纹萌生与氢键断裂细节,而分子动力学(MD)模拟恰能在原子层面揭示这些本质机理。借助 GROMACS 这一高性能开源 MD模拟软件,我们在本案例中对 Ih冰进行拉伸模拟,可视化冰晶格在不同应变阶段的演变,为设计抗脆裂冰结构与调控极端低温材料性能提供前瞻性思路。
水的相图非常复杂 (图1),而Ih型冰是常压下冰的最稳定的晶型,因此在本案例中我们的研究对象为Ih型冰。

图1 水的相图
Hayward 和Reimers在J.Chem.Phys.,106,1518 (1997) 中详细讨论了如何得到不同约束条件下Ih冰的结构,并给出了几个常用Ih结构的坐标文件,可用于快速搭建冰的模型。我们选用的冰晶胞的初始模型如图2所示:

图2 冰晶胞模型
在本案例中,我们考察冰晶胞在200ps内伸长3nm的过程。用tip4p-ice描述水,温度控制在250K,采用NPT。为了实现拉伸模拟,我们需要在参数控制文件中加入以下参数:deform= 0 0 0.015 0 0 0 采用半各向异性控压,部分参数如图3所示:

图3 部分mdp参数
经过能量最小化和200ps的模拟后,我们可以考察冰晶格的变化,如图4所示。可以看到,在拉伸35ps时冰晶胞即将被破坏,到200 ps的时候已经完全破坏了。还可以考察冰拉伸过程中的能量变化,可以看到拉伸过程中系统的能量一直在升高,如图5所示。

图4 拉伸过程冰晶胞的变化

图5 拉伸过程冰晶胞的能量变化
通过GROMACS分子动力学模拟,本案例成功探究了冰晶胞拉伸的演变过程。对于相关领域的研究人员和工程师来说,本案例提供了一个有力的工具,可以为解决实际问题提供理论依据和技术支持。