GROMACS分子动力学模拟仿真22讲:自学冰热融化、离子溶液、界面模型、纳米管和蛋白建模仿真分析

播放量5163次
5分
订制培训
共22讲 更新到第22讲
当前总时长:6小时15分30秒
¥399
VIP用户九折
成为VIP
简介
目录(试看)
评价

服务:

  • 课程资料下载
  • 90天知识圈
  • 在线开票
  • 提供培训通知

本课适合哪些人学习:

课程目标:进一步了解GROMACS相关知识

适用人群:在分子动力学模拟方面零基础、想进一步提升自己的模拟技术


你会得到什么:


课程介绍:

GROMACS是用于研究生物、化学、物理等学科中分子微观机理的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。

它的模拟程序包含GROMACS力场、AMBER力场等诸多力场,研究的范围可以包括玻璃和液晶、聚合物、晶体、界面体系和生物分子溶液(蛋白质、核苷酸、糖等)。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。

  • 该课程拟在为从事上诉科研领域人员提供GROMACS软件专业培训,提高相关人员的技术水平。

  • 无论您前期是否接触过此软件,均可通过此次培训更加熟练的运用本领域的计算仿真。

  • 该课程通过由易到难的知识讲解,让您对GROMACS软件使用有一个全面系统的学习,更好的补充您在自学中忽略的知识内容。

长图.jpg

     

  • 第一章 分子模拟入门理论
  • 第1讲 分子模拟入门理论-1.1-基本理论
  • 第2讲 分子模拟入门理论-1.2-模拟流程参数介绍
  • 第二章 GROMACS入门操作基础
  • 第3讲 GROMACS入门操作基础-2.1-linux入门基础
  • 第4讲 GROMACS入门操作基础-2.2-windows安装
  • 第5讲 GROMACS入门操作基础-2.3-linux安装
  • 第6讲 GROMACS入门操作基础-2.4-输入输出文件讲解
  • 第7讲 GROMACS入门操作基础-2.5-力场讲解
  • 第三章 GROMACS建模
  • 第8讲 GROMACS建模-3.1-各种建模软件的使用
  • 第9讲 GROMACS建模-3.2-界面模型,混合溶剂模型,纳米结构模型建模
  • 第10讲 GROMACS建模-3.3-分子TOP文件构建(上)
  • 第11讲 GROMACS建模-3.4-分子TOP文件构建(下)
  • 第四章 GROMACS初阶计算实例
  • 第12讲 GROMACS初阶计算实例-4.1-冰的加热融化模拟
  • 第13讲 GROMACS初阶计算实例-4.2-离子溶液的模拟方法
  • 第14讲 GROMACS初阶计算实例-4.3-界面模型的模拟
  • 第15讲 GROMACS初阶计算实例-4.4-物理场下的模拟
  • 第16讲 GROMACS初阶计算实例-4.5-纳米管的模拟
  • 第17讲 GROMACS初阶计算实例-4.6-自带分析工具讲解
  • 第五章 GROMACS中阶计算实例
  • 第18讲 GROMACS中阶计算实例-5.1-蛋白建模模拟
  • 第19讲 GROMACS中阶计算实例-5.2-蛋白相关性质的分析
  • 第20讲 GROMACS中阶计算实例-5.3-蛋白配体复合物的模拟
  • 第21讲 GROMACS中阶计算实例-5.4-计算蛋白配体结合自由能
  • 第22讲 GROMACS中阶计算实例-5.5-表面活性剂的构建和模拟
著作权归作者所有,欢迎分享,未经许可,不得转载
首次发布时间:2023-08-14
最近编辑:1月前
VIP会员 学习 福利任务 兑换礼品
下载APP
联系我们
帮助与反馈