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关于范德华力的一些知识
范德华力的定义是十分模糊的，以至于不同领域给出的答案可能有很大出入，我们国内教材上所说的范德华力大致都是这么说的：“范德华力是一种分...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2626
什么是相空间？
1.相空间（phasespace）相空间是以位置和动量（q,p）为坐标的一个二维空间，通常用符号表示。该位置和动量坐标等同于统计力学中常用的广义的(...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1716
对氨基酸进行突变的简单方法
在动力学模拟蛋白、多肽过程中，有时候需要模拟某个氨基酸位点突变的情况。下面简单的方法对氨基酸进行突变，即使用WHATIF服务器。此方法不用...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1083
什么是蛋白的Ramachandran图（拉氏图）
Ramachandranplot（拉氏图）是由G.N.Ramachandran等人[1]于1963年开发的，用来描述蛋白质结构中氨基酸残基二面角ψ和φ是否在合理区域的一种可...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1828
二级结构分析DSSP安装
GROMACS程序调用第三方软件DSSP，从轨迹文件中读出蛋白质的二级结构信息。要使用该程序，必先安装好DSSP软件。不过目前DSSP网站有时候打不开，...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
918
生成小分子力场TOP（ITP）文件(五)：生成UFF力场
目前，在线生成UFF力场的网址已经不能访问，但是官方提供了一个离线版的obgmx程序可以使用。此离线版程序obgmx需要搭建openbabel环境。下面为...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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DeepChem教程-1.1：DeePChem介绍
深度生命科学的基本工具欢迎来到DeepChem的深度生命科学入门教程。本系列笔记本是一个循序渐进的指南，可帮助您了解为生命科学进行深度学习所...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2834
DeepChem教程-1.2：使用数据集
使用数据集数据是机器学习的核心。本教程介绍DeepChem用于存储和管理数据的“Dataset”类，它为处理大量数据提供了简单且功能强大的功能，它支...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2170
DeepChem教程-1.3：MoleculeNet
MoleculeNet简介DeepChem最强大的功能之一是它带有“包含电池”的数据集供使用。DeepChem开发者社区维护着MoleculeNet[1]数据集套件，该套件维...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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影响纤维增强聚合物基复合材料疲劳行为的因素
《FactorsAffectingtheFatigueBehaviorofFiber‑ReinforcedPolymerMatrixComposites》作者为C.HemanthKumar、ArunkumarBongale和C.S.Venkates...
气瓶设计的小攻城狮
从事IV储氢气瓶行业。
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