精品课加餐-8:氢键多维分析-从全局统计到局部特征的计算方法

精品课加餐-8:氢键多维分析-从全局统计到局部特征的计算方法

距 07月09日 20:00 开播还有
1064851

还在为gromacs无法分析特定区域的氢键而困扰?我们全新开发的氢键定向分析工具,让您彻底告别局限!只需简单指定目标区域(如结合口袋、酶活性位点、材料界面),即可实现以下功能。2025年7月9日20时,仿真秀优秀讲师,北京大学博士后刘十三613老师将使用Gromacs软件,围绕“氢键多维分析-从全局统计到局部特征的计算方法”主题,给给分子动力学模拟爱好者和Gromacs用户做一起线上公开课(欢迎Gromacs课程订阅用户报名参加直播加餐)。以下是直播的具体安排:

一、主讲嘉宾

企业微信截图_17518496094869.png

刘十三613  北京大学博士后 仿真秀优秀讲师,资深分子模拟专家。他拥有丰富的分子模拟专业知识和科学研究经验,长期从事该领域重大项目研究,具有深厚的技术底蕴和专业背景。他在仿真秀为用户提供付费答疑和F分子动力学模拟技术指导,请点击查看分子动力学、第一性原理计算一对一指导、答疑

他在仿真秀的课程与培训作品如下:

1、GROMACS 分子动力学模拟培训(点击报名)

2、GROMACS新手进阶必修课20讲:开启分子模拟科研之旅(2024版)

更多内容请点击查看【刘十三613仿真专栏】

二、讲座主要内容

1、核心功能亮点:

第一、区域精准锁定

  • 自由框选任意目标区域(支持坐标范围/残基编号/原子组)

  • 动态追踪区域间氢键(如蛋白质-配体、溶剂-膜、纳米粒子-聚合物)

第二、全维度参数输出

  • 数量统计:时序氢键数量、长度、角度

  • 几何参数:

    1)键长(D-H…A)精确至0.01Å

    2)键角(∠D-H…A)动态范围150°-180°

第三、强度可视化革命:键长-角度联合热图

  • 首创双参数热图技术,直观揭示氢键强度规律:

    1)X轴:氢键长度(Å) → 越短越强

    2)Y轴:氢键角度(°) → 越接近180°越稳定

    3)热力色彩:暖色=高概率强氢键,冷色=弱/不稳定区域

2、颠覆性的应用场景

  • 药物设计:定位结合口袋内强效氢键,指导抑制剂优化

  • 生物膜研究:分析跨膜通道水分子链的氢键导向机制

  • 材料科学:表征聚合物界面氢键网络稳定性

  • 酶催化:揭示活性中心关键氢键的动态演化

3、专业答疑:刘老师坐镇,为您的每一个疑问提供详尽解答。

  • 现场互动:不仅可以提前提交问题,还有机会现场连线,与专家面对面交流。

  • 问题准备:每位参与者可以准备2-3个问题



三、适合谁看

1、理工学学子和高校教师;

2、化学、生物、物理科研工作者

3、分子动力学模拟兴趣爱好者和应用者

4、GROMACS仿真软件用户和兴趣爱好者


VIP会员 学习计划 福利任务
下载APP
联系我们
帮助与反馈